Продукция

Новости

Стены из кирпича видео
Строил дом. Планирую, что он станет таким себе семейным гнездышком для нас всех и что мы будем жить тут долго и счастливо. Потому делал все максимально качественно, старался зря денег не жалеть. Нет,

Кладка кирпича цоколь видео
В детстве я была довольно небрежна к своей осанке, в результате схлопотала сколиоз. С годами все усугубилось, и добавился остеохондроз. Две беременности и ношение детей в слинге никак не способствовали

Перегородка из кирпича видео
Качественные электроды для ручной сварки сейчас купить не так и легко, потому что в наше время очень много подделок. Этот сайт предлагает действительно качественные и надежные электроды по очень доступный

Камин из кирпича видео
Добрый день. Сегодня хочу Вам рассказать про отличную бизнес-идею для начинающих предпринимателей. Представьте следующую ситуацию: Фирма собирается переезжать в другой, более крупный офис. И, конечно,

Камины из кирпича своими руками видео
В летний период занимаюсь косметическим ремонтом квартир. Работа не основная, сезонная, но приносит неплохой доход. Чтобы клиенты будущие обращались ко мне, нужно, чтобы уже имеющиеся говорили обо мне

Кладка кирпича видео уроки
Как часто в наши дни родители обеспокоены тем, что дети все свободное время проводят, играя в компьютерные игры. Как занять их чем-то полезным, развивающим и при этом интересным для них? Предложите им

Видео кладка кирпича своими руками
Для того, чтобы определиться с тем, какие двери установить в своем доме недостаточно просто выбрать из тех, что предлагаются на рынках. Более разумно посмотреть на фото, которые четко дадут понять, как

Видео урок кладка кирпича
Компания "Звездный дом" поможет осуществить вашу мечту купить дом на фиоленте Этот поистине райский уголок на берегу Черного моря расположен вдали от городской суеты, здесь открываются чудесные виды на

Кладка кирпича в один кирпич видео
В детстве я очень любила смотреть бразильские сериалы. Большой дом с зеленой лужайкой, большая семья, успешные главные герои, жизнь как в сказке, страсти, интриги - вот она, казалось, насыщенная и интересная

Объекты

Поиск

Глава 4.1. Первинна структура ::: Структура ::: Білок і все про нього в біології і хімії

Глава 4. Структура

4.1. первинна структура

первинна структура

Являє собою лінійну ланцюг амінокислот, розташованих в певній послідовності і з'єднаних між собою пептидними зв'язками. Пептидний зв'язок утворюється за рахунок Являє собою лінійну ланцюг амінокислот, розташованих в певній послідовності і з'єднаних між собою пептидними зв'язками -карбоксільной групи однієї амінокислоти і -амін групи інший:

Пептидний зв'язок утворюється за рахунок   -карбоксільной групи однієї амінокислоти і   -амін групи інший:


Пептидний зв'язок внаслідок p, Пептидний зв'язок внаслідок p,   -сопряженія   -зв'язку карбонільної групи і р-орбіталі атома N, на якому знаходиться не поділена пара електронів, не може розглядатися як одинарна і обертання навколо неї практично відсутня -сопряженія -зв'язку карбонільної групи і р-орбіталі атома N, на якому знаходиться не поділена пара електронів, не може розглядатися як одинарна і обертання навколо неї практично відсутня. З цієї ж причини хіральний атом і карбонільний атом будь-якого i-го амінокислотного залишку пептидного ланцюга і атоми N і (I + 1) -го залишку знаходяться в одній площині. У цій же площині знаходяться карбонільний атом О і амідний атом Н (проте накопичений при вивченні структури білків матеріал показує, що це твердження не зовсім строго: атоми, пов'язані з пептидним атомом азоту , Знаходяться не в одній площині з ним, а утворюють тригранну піраміду з кутами між зв'язками, дуже близькими до 120 градусів. Тому між площинами, утвореними атомами , Існує деякий кут, що відрізняється від 0. Але, як правило, він не перевищує 1 і не грає особливої ​​ролі). Тому геометрично полипептидную ланцюжок можна розглядати як утворену такими плоскими фрагментами, що містять кожен по шість атомів. Взаємне розташування цих фрагментів, як і будь-яке взаємне розташування двох площин, має визначаться двома кутами. Серед таких прийнято брати торсіонні кути, що характеризують обертання навколо -зв'язків N- і - .

Геометрія будь молекули визначається трьома групами геометричних характеристик її хімічних зв'язків - довжинами зв'язків, валентними кутами і торсійними кутами між зв'язками, що примикають до сусідніх атомів. Перші дві групи у вирішальній мірі визначаються природою беруть участь атомів і утворюються зв'язків. Тому просторова структура полімерів в основному визначається торсійними кутами між ланками полімерного остова молекул, тобто конформацией полімерного ланцюга. Торсійний кут, тобто кут повороту зв'язку А-В навколо зв'язку В-С щодо зв'язку С-D, визначається як кут між площинами, що містять атоми А, В, С і атоми B, C, D.

Торсійний кут, тобто  кут повороту зв'язку А-В навколо зв'язку В-С щодо зв'язку С-D, визначається як кут між площинами, що містять атоми А, В, С і атоми B, C, D

У такій системі можливий випадок, коли зв'язку А-В і С-D розташовані паралельно і перебувають по одну сторону від зв'язку В-С. Якщо розглядати цю систему уздовж зв'язку В-С, то зв'язок А-В як би затуляє зв'язок CD, тому така конформація називається заслоненной. Згідно з рекомендаціями міжнародних союзів хімії IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) і IUB (International Union of Biochemistry), кут між площинами ABC і BCD вважається позитивним, якщо для приведення конформації в заслоненного стан шляхом повороту на кут не вище 180 ближню до спостерігача зв'язок потрібно повертати за годинниковою стрілкою. Якщо цей зв'язок для отримання закритої конформації потрібно повертати проти годинникової стрілки, то кут вважається негативним. Можна помітити, що це визначення не залежить від того, яка з зв'язків знаходиться ближче до спостерігача.

При цьому, як видно з малюнка, орієнтація фрагмента, що містить атоми При цьому, як видно з малюнка, орієнтація фрагмента, що містить атоми   i + 1 і   i [(i-1) -й фрагмент], і фрагмента, що містить атоми   i і   i + 1 (i-й фрагмент), визначається торсійними кутами, відповідними обертанню навколо зв'язку N i-   i і зв'язку   i -   i i + 1 і i [(i-1) -й фрагмент], і фрагмента, що містить атоми i і i + 1 (i-й фрагмент), визначається торсійними кутами, відповідними обертанню навколо зв'язку N i- i і зв'язку i - i. Ці кути прийнято позначати як і , В наведеному випадку відповідно i і i. Їх значеннями для всіх мономерних ланок поліпептидного ланцюга в основному визначається геометрія цьому ланцюзі. Ніяких однозначних величин ні для значення кожного з цих кутів, ні для їх комбінацій не існує, хоча на ті і на інші накладаються обмеження, які визначаються як властивостями самих пептидних фрагментів, так і природою бічних радикалів, тобто природою амінокислотних залишків.

До теперішнього часу встановлено послідовності амінокислот для декількох тисяч різних білків. Запис структури білків у вигляді розгорнутих структурних формул громіздка і не наочна. Тому використовується скорочена форма запису - трибуквених або однобуквеним (молекула вазопресину):

Тому використовується скорочена форма запису - трибуквених або однобуквеним (молекула вазопресину):

При записи амінокислотною послідовності в поліпептидних або олігопептідних ланцюгах за допомогою скороченою символіки передбачається, якщо це не обумовлено, що При записи амінокислотною послідовності в поліпептидних або олігопептідних ланцюгах за допомогою скороченою символіки передбачається, якщо це не обумовлено, що   -аминогруппами знаходиться зліва, а   -карбоксільная група - справа -аминогруппами знаходиться зліва, а -карбоксільная група - справа. Відповідні ділянки поліпептидного ланцюга називають N-кінцем (аміни кінцем) і С-кінцем (карбоксильних кінцем), а амінокислотні залишки - відповідно N-кінцевим і С-кінцевим залишками.